自体骨髓移植的优点是：细胞采集方便、简单，不存在供体紧缺问题；细胞取自于自身，不会发生免疫排斥反应；自体细胞移植几乎等同于自体输血，安全性极高，几乎没有不良发应，更无外源性污染和疾病传播问题；操作安全，创伤小，痛苦小，费用低，具有独特的优势和广阔的应用前景。可以说是疗效显著、见效快。而自体骨髓移植的缺点是：肝静脉闭塞症；免疫缺陷性感染移植后患者容易感染；很少但是会出现间质性肺炎等情况。
骨髓的重要功能就是产生生成各种血细胞的，会一直源源不断的复制，不会被用完的，除非有一天再患上了血液的疾病。这些通过分化再生成各种血细胞如红细胞、白细胞、血小板、淋巴细胞等，简单的说骨髓的作用就是造血功能。
优点就是自体骨髓移植治疗，对于严重肝炎、肝硬化患者的肝功能异常甚至衰竭的改善非常有效，而且所需费用较肝脏移植低几十倍，治疗过程中患者几乎没有痛苦。
器官移植的一种，将正常骨髓由静脉输入患者体内，以取代病变骨髓的治疗方法。用以治疗造血功能异常、免疫功能缺陷、血液系统恶性肿瘤及其他一些恶性肿瘤。用此疗法均可提高疗效，改善预后，得到长生存期乃至根治。 移植分两类 一类为异基因骨髓移植（1970年代以来临床应用，已取得很大的成功）。它需有与患者人类白细胞抗原 (HLA)相匹配的同胞兄弟、姐妹以及极少数的无亲缘关系的供髓者所输入的异体骨髓，或家庭成员间如父母和子女的骨髓移植;以及与患者HLA不很匹配的无关供者的骨髓。非同胞的兄弟姐妹虽HLA相匹配，但易发生轻重不等的移植物抗宿主病(GVHD)，尤其在后一种情况更严重。另一类为同基因骨髓移植，即极少数的同卵双胎孪生兄弟或姐妹间的骨髓移植。 还有一类为自体骨髓移植(ABMT)。此类骨髓移植开展较晚，80年代应用于临床。用自身的骨髓，不需供髓者,此法简便,易于推广，可用于独生子女，并且无GVHD的发生。用于白血病，淋巴瘤和多种实体瘤的治疗。
骨髓移植即造血移植，有的造血来源于骨髓，有的来源于外周血，有的来源于脐带。所以移植可以是造血自体的，也可以是异体的。所以移植在临床上现在是治疗某些疾病的重要手段，是主流治疗。但是治疗方法毕竟有好的一面，也有不好的一面。如造血移植，主要的适应症是针对临床一般手段治疗疗效不太好的疾病，如血液病里面预后特别差的血液肿瘤，如白血病、多发性骨髓瘤、淋巴瘤等。还有贫血，如再生障碍性贫血、遗传引起的贫血。用于免疫治疗，对免疫缺陷、免疫病等做移植的治疗。比较大的好处是相对于其它治疗手段，移植疗效比其它手段可能更好，疗效更高。但是它不好的地方是：
1、治疗费用大，患者经济负担会加重；
2、移植治疗本身会有并发症，不论医生或病人，要认识到这一点，这些并发症有的是药物引起的，有的跟免疫有关。所以对肾脏、皮肤、胃肠道、肺、眼睛等器官可能会造成损伤，影响生活质量，甚至部分并发症可能还会危及生命。
优点就是自体骨髓移植治疗，对于严重肝炎、肝硬化患者的肝功能异常甚至衰竭的改善非常有效，而且所需费用较肝脏移植低几十倍，治疗过程中患者几乎没有痛苦。
缺点就是这类手术难度大，比较好找做个这类手术的知名专家作．